上海海关学院前身为创建于1953年的上海海关学校;1980年5月,经国务院批准,升格为上海海关专科学校;1996年4月,原国家教委批准更名为上海海关高等专科学校;2007年3月,经教育部批准,设立上海海关学院,成为新设置的全日制普通高等学校。
学校注册地址为上海市浦东新区华夏西路5677号,占地面积521亩。另设苏州分校,位于苏州市吴中区舟山路58号,占地面积125亩;滴水湖国际校区,位于上海市浦东新区临港大道11号,占地面积12亩。

学校现设有海关与公共管理学院、海关与公共经济学院、工商管理与关务学院、海关法律系、海关外语系、公共教学部、马克思主义学院和海关检验检疫系等八个院(系);设置了海关管理、海关检验检疫安全、海关稽查、行政管理、物流管理、审计学、国际商务、税收学、经济统计学、法学、英语、数据科学与大数据技术等12个本科专业、国家安全学一级学科硕士学位点和公共管理硕士、税务硕士、国际商务、数字经济、翻译硕士5个专业学位点,分属交叉学科、管理学、经济学、法学、文学、工学等学科门类。

学校设有海关管理研究所和海关法、海关风险管理、关税、海关公共关系、报关等研究中心,紧密结合海关改革发展和双边、多边、区域海关国际合作中面临的热点、难点问题开展科学研究。
学校宿舍大部分是上床下桌,部分是四人间或五人间上下铺(配有桌子 ),有空调,有阳台。宿舍有独立卫生间(蹲厕),但是卫生间不能洗澡,沐浴是在带隔间的公共浴室。
学生食堂
学苑餐厅分为两层,内有面包房和小超市,进入正门右侧有多层储物柜,二楼也有同样的多层储物柜,值得注意的是只有一楼提供早餐,一楼中午有饭菜、面食、麻辣烫的窗口,晚上有饭菜、麻辣烫的窗口,二楼中午晚上都有饭菜与西北风味的面食。
图书馆
图书馆位于“花园式校区”的正中,两侧小桥与河水环绕,环境优雅。全馆共三层楼面,楼层服务定位各有侧重。